Derzeit arbeiten wir an der Entwicklung einer Datenpipeline zur automatischen Auswertung von Real Time PCR Daten. Mit dieser Methode kann die Aktivität von Genen quantitativ gemessen werden.
Der Code wird mit R unter Benutzung des R Pakets „qpcR“ geschrieben. Dabei werden die Daten vom Einlesen der Rohdaten, der Kontrolle der Datenqualität bis hin zur grafischen Darstellung der Resultate aufgearbeitet. Das Ziel ist die Messung der Genaktivität von isolierten Knorpelzellen die im Rahmen von Parabelflügen der Schwerelosigkeit ausgesetzt waren. Es werden alle Gene betrachtet, die im Zusammenhang mit Knorpelwachstum und -regeneration eine Rolle spielen.
